R 工作室："Error in system(command, intern = T) : 'ls' not found"

Question

我正在使用R studio的GenABEL包将Affymetrix Genotype控制台的输出转换为.tfam文件。这是我迄今为止的代码：

rm(list = ls())
setwd("C:/U/Is/GD/Affymetrix")
library("GenABEL", lib.loc="C:/PROGRA~1/R/R-211~1.1-X/library")
read.table("Genotyping_results.txt", fill = TRUE)
convert.snp.affymetrix(dir = "C:/U/Is/GD/Affymetrix", map = "Genotyping_results.txt" , outfile ="Genotyping_results.tfam")

我收到以下错误："系统错误（命令，intern=T）：找不到'ls'"我对编程的理解有限，发现很难理解哪里出了问题或如何解决问题

如有任何帮助，将不胜感激

Answer 1

您在评论中提到您正在使用Windows。ls不是操作系统上的命令。

ls是Linux和R.中的一个命令

有很多方法可以将该命令添加到Windows中，比如Cygwin。