'phytools' R 包中的 phyl.vcv 函数计算两个变量之间的系统发育特征方差-协方差矩阵。
我可以使用此矩阵来计算系统发育皮尔逊 r 值吗?如果是这样,是否可以在 t 检验(使用 n-2 df(中使用此 r 值来检验相关性的显著性?
Liam Revell在他的博客上发布了一个解决方案,其中包含R代码:http://blog.phytools.org/2017/08/pearson-correlation-with-phylogenetic.html