运行VASP 5.4.1时的分段故障

Question

因此，我们正在尝试在Ubuntu 14.04 LTS上编译VASP 5.4.1。遵循此处描述的类似安装步骤：如何使用GNU编译器编译Linux Debian的VASP 5.4.1。但是，在测试VASP可执行文件（VASP_STD等）时，该程序会以分段故障终止 - 无效的内存参考错误。

我们目前拥有的makefile.ixlude是：

# Precompiler options
CPP_OPTIONS= -DMPI -DHOST="IFC91_ompi" -DIFC 
         -DCACHE_SIZE=4000 
         -DMPI_BLOCK=8000 -DscaLAPACK -Duse_collective 
         -DnoAugXCmeta -Duse_bse_te 
         -Duse_shmem -Dtbdyn
CPP        = gcc -E -P -C $*$(FUFFIX) >$*$(SUFFIX) $(CPP_OPTIONS)
FC         = mpif90
FCL        = mpif90
FREE       = -ffree-form -ffree-line-length-none
FFLAGS     =
OFLAG      = -O2
OFLAG_IN   = $(OFLAG)
DEBUG      = -O0
LIBDIR     = /usr/lib/x86_64-linux-gnu
BLAS       = -L$(LIBDIR) -lblas
LAPACK     = -L$(LIBDIR) -llapack
BLACS      = -L$(LIBDIR) -lblacs-openmpi -lblacsCinit-openmpi
SCALAPACK  = -L$(LIBDIR) -lscalapack-openmpi $(BLACS)
OBJECTS    = fftmpiw.o fftmpi_map.o  fftw3d.o  fft3dlib.o 
         /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libfftw3.a
INCS       =-I/usr/include
LLIBS      = $(SCALAPACK) $(LAPACK) $(BLAS)
OBJECTS_O1 += fft3dfurth.o fftw3d.o fftmpi.o fftmpiw.o chi.o
OBJECTS_O2 += fft3dlib.o
# For what used to be vasp.5.lib
CPP_LIB    = $(CPP)
FC_LIB     = $(FC)
CC_LIB     = gcc
CFLAGS_LIB = -O
FFLAGS_LIB = -O1
FREE_LIB   = $(FREE)
OBJECTS_LIB= linpack_double.o getshmem.o
# Normally no need to change this
SRCDIR     = ../../src
BINDIR     = ../../bin

运行后：

mpirun -np 8 /home/<user>/VASP/vasp.5.4.1/bin/vasp_std

该程序运行一段时间，然后用许多分割故障消息终止（我最后一次运行它给了其中8个！）：

Program received signal SIGSEGV: Segmentation fault - invalid memory reference.
Backtrace for this error:
#0  0x7F62EE595777
#1  0x7F62EE595D7E
#2  0x7F62EDA95CAF
#3  0x4DE3EA in __nonl_MOD_spher
#4  0x637E84 in __msphpro_MOD_sphpro
#5  0xC1E013 in MAIN__ at main.f90:?

任何见解都将不胜感激。

Answer 1

实际上，它与您的VASP汇编无关，这取决于Linux系统中的某个设置。我不确定这是否有效，在您在命令行处的每个任务之前，请输入：

ulimit -s unlimited