r语言 - 使用调试符号中的行信息编译 Rcpp 包

Question

我不知道如何为我的 R 包的共享库的调试符号提供源代码行信息。我错过了什么？

1. 我创建以下src/Makevars文件：

   PKG_CXXFLAGS=-O0 -ggdb
   PKG_LIBS=-O0 -ggdb
   

2. 我使用R CMD INSTALL --no-multiarch --with-keep.source编译包：

   * installing to library ‘~/.local/lib/R/3.6’
   * installing *source* package ‘reticulate’ ...
   ** using staged installation
   g++ -std=gnu++11 -I"/usr/include/R/" -DNDEBUG  -I"$HOME/.local/lib/R/3.6/Rcpp/include" -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O0 -ggdb -fpic  -march=x86-64 -mtune=generic -O2 -pipe -fno-plt  -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o
   ** libs
   g++ -std=gnu++11 -shared -L/usr/lib64/R/lib -Wl,-O1,--sort-common,--as-needed,-z,relro,-z,now -o reticulate.so RcppExports.o event_loop.o libpython.o output.o python.o readline.o -O0 -ggdb -L/usr/lib64/R/lib -lR
   

   安装到 ~/.local/lib/R/3.6/00LOCK-reticulate/00new/reticulate/libs

3. 我像这样调试：

   R -d gdb --slave -e 'reticulate::py_eval("print")()'
   GNU gdb (GDB) 8.3
   [...]
   (No debugging symbols found in /usr/lib64/R/bin/exec/R)
   (gdb) break py_get_formals
   Function "py_get_formals" not defined.
   Make breakpoint pending on future shared library load? (y or [n]) y
   Breakpoint 1 (py_get_formals) pending.
   (gdb) run
   Starting program: /usr/lib/R/bin/exec/R --slave -e reticulate::py_eval("print")()
   [Thread debugging using libthread_db enabled]
   Using host libthread_db library "/usr/lib/libthread_db.so.1".
   [...]
   Thread 1 "R" hit Breakpoint 1, 0x00007fffeb6b79a0 in py_get_formals(PyObjectRef, bool) () from /home/angerer/.local/lib/R/3.6/reticulate/libs/reticulate.so
   (gdb) step
   Single stepping until exit from function _Z14py_get_formals11PyObjectRefb,
   which has no line number information.
   [...]
   

为什么我的函数没有行号，即使我在两个编译中都指定了-ggdb？我看到命令行中只提到了RcppExports.cpp，这是问题所在吗？如果是这样，我该如何更改？

Answer 1

更改 Makevars 不会提示重新编译。

我需要在重新编译目标文件之前rm -f src/*.o src/*.so。

Answer 2

这是专门针对Windows的。最简单的方法是将R_MAKEVARS_USER环境设置为指向 Makevars.win 文件。这似乎有效。但是，调试断点已停止工作!!!