R保存图像以创建用大量点增量生成的绘图动画



我正试图创建一个基于散点图的动画,该散点图是随着时间的推移逐渐构建的。用例是,我有一个大约200万个点的数据库,每个点都有时间戳,并且希望生成显示特定日期或之前所有点的帧。

在不保存图像的情况下,我可以通过首先调用plot(),然后使用一个for循环来使用points()函数递增地绘制连续一天的数据。

当我尝试使用下面的代码保存图像时,我会收到一个错误"plot.new尚未调用"。据我所知,dev.off()是保存图像所必需的,但这也关闭了被绘制到的设备。有办法绕过这一点吗?由于数据的大小,必须为每一帧重新绘制数据并不是一个很大的选择。

plot(info$lon, info$lat, xlim=c(0,30), ylim=c(30,60))
for (i in c(1:length(allDates))){
    filename=paste(sprintf('%05d', i), ".png", sep="")  
    png(filename=fileName)
    # (code that gets the data for a particular date via a database query)
    points(info$lon, info$lat, cex=0.1)
    dev.off()
}

更新:@roman lustik关于ggsave()的评论正是我想要的,并产生了以下代码:

plotObj = ggplot(...) + geom_point() + xlim(...) + ylim(...)
for (i in c(1:length(allDates))){
    filename=paste(sprintf('%05d', i), ".png", sep="")  
    # (code that gets the data for a particular date via a database query)
    plotObj = plotObj + geom_point(data=info, aes(x=lon, y=lat), size=0.5)
    print(plotObj)
    ggsave(filename=filename, width=6, height=6)
}

然而,这仍然有点慢,所以我目前快速渲染图像的解决方案是使用与原始代码类似的代码,但我只使用plot()来渲染带有单个日期数据的帧(使用透明背景)。为了逐步堆叠图像,我使用bash脚本,该脚本使用imagemagik convert -composite命令将两个图像混合在一起。然后将该混合图像与下一个日期的图像混合,以此类推,直到最终图像显示所有数据:

#!/bin/bash
for i in $files
do
    convert $prevFile $i -composite ./stackedImages/$i
    prevFile=./stackedImages/$i
done

如果我已经理解了,你想得到几个png文件,上面有不同数量的点,第一个点是由plot(info$lon, info$lat, xlim=c(0,30), ylim=c(30,60))创建的。

你可以这样做:

temp1 <- info$lon
temp2 <- info$lat
for (i in c(1:length(allDates))){
        filename=paste(sprintf('%05d', i), ".png", sep="")  
        png(filename=fileName)
        plot(temp1, temp2, xlim=c(0,30), ylim=c(30,60))
        # (code that gets the data for a particular date via a database query)
        points(info$lon, info$lat, cex=0.1)
        dev.off()
        temp1 <- c(temp1,info$lon)
        temp2 <- c(temp2,info$lat)
}

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