r语言 - 我使用ALDEx包来分析PICRUST2输出，并给了我一个错误

Question

我遵循下面的教程链接:

https://ycl6.github.io/16S-Demo/4_picrust2_tutorial.html

复制代码后:

# EC
set.seed(12345)
system.time({
aldex2_EC1 = aldex(p2EC1, sample_data(ps1a)$Group, mc.samples = 500, test = "t", 
effect = TRUE, denom = "iqlr", verbose = TRUE)
})

在aldex.clr.function(as.data.frame(reads)， conds, mc.samples, dom，样本数量与条件向量不匹配。

我正在研究5或6个样品。我不知道错误的原因是什么

我在google上找不到答案。

Answer 1

您可以在ggpicrust2包中使用pathway_daa()。它支持数十种数据处理方法，包括ALDEx2，它的工作非常容易。