将.tab文件转换为pandas数据帧

Question

下载.tab文件后，我正试图将其转换为pandas-df，但当我运行这行代码时，它看起来非常奇怪：

df = pd.read_csv('/Users/me/HUMAN_9606_idmapping_selected.tab',  sep ='t', nrows=10)

文件：https://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/idmapping/by_organism/HUMAN_9606_idmapping_selected.tab.gz

如何将其转换为常规df？

Answer 1

您甚至不需要提取它，看起来您没有标题，所以您应该指定header=None:

df = pd.read_csv('HUMAN_9606_idmapping_selected.tab.gz', sep='t', header=None)
# OR
df = pd.read_table('HUMAN_9606_idmapping_selected.tab.gz', header=None)