使用R-INLA运行混合效果模型时出现错误消息

Question

我正在使用R-INLA运行以下模型(治疗、动物.1和动物.2是因素，接触长度是连续的(：

formula <- Encounter.Length ~ Treatment +f(Animal.1, model = "iid", n = n.animal) + 
f(Animal.2, copy = "Animal.1")
m.1 <- inla(formula, data = inla.dat)

然而，在运行此代码后，我收到以下错误消息：

inla错误(公式，数据=inla.dat(：在f(Animal.1(中："协变"必须与"值"匹配，并且两者都必须是"数值"或"因子"/"字符"。

我是使用INLA的新手，想知道这个错误消息意味着什么以及如何修复它。

Answer 1

答案(来自r-inla.help(：B的级别不是a的子集(用于定义B复制的模型(。因此，您必须在级别上定义并集上的模型。

例如：

n <- 3 
A <- as.factor(letters[1:n]) 
B <- as.factor(letters[1+1:n]) 
y <- 1:n 

这不起作用

inla(y ~ -1 + f(A) + f(B, copy = "A"), data = data.frame(A, B)) 

但确实如此

values <- as.factor(unique(c(levels(A), levels(B)))) 
inla(y ~ -1 + f(A, values = values) + f(B, copy = "A"), 
data = list(A = A, B = B, values = values))