r-群集HNSC TCGA数据的iClusterPlus错误



我正在使用iClusterPlus包为HNSC TCGA数据集进行聚类

我有两个错误

第一个

**fit.single=iClusterPlus(dt1=df_m_tong1,dt2=df_c_tong1,dt3=df_e_tong1,
type=c("binomial","gaussian","gaussian"),
lambda=c(0.04,0.61,0.90),K=2,maxiter=10)**

数据类型(dt1,类型[1],K(错误:错误:二项式数据的某些列由不等于2的类别组成,必须删除。

但是,我有二项式突变数据

第二,

**for(k in 1:5){
cv3.fit = tune.iClusterPlus(cpus=5,dt1=df_m_tong1,dt2=df_c_tong1,dt3=df_e_tong1,
type=c("binomial","gaussian","gaussian"),K=k,n.lambda=185, 
scale.lambda=c(0.05,1,1),maxiter=20)
save(cv3.fit, file=paste("cv3.fit.k",k,".Rdata",sep=""))
}**

使用185个Lambda点来调整参数。开始并行计算结束并行计算使用185个Lambda点来调整参数。开始并行计算结束并行计算使用185个Lambda点来调整参数。开始并行计算结束并行计算使用185个Lambda点来调整参数。开始并行计算结束并行计算使用185个Lambda点来调整参数。开始并行计算结束并行计算警告消息:1:在mclapply(1:nrow(ud(中,FUN=函数(x(iClusterPlus(dt1,dt2,:185个函数调用导致错误2:在mclapply(1:nrow(ud(中,FUN=函数(x(iClusterPlus(dt1,dt2,:185个函数调用导致错误3:在mclapply(1:nrow(ud(中,FUN=函数(x(iClusterPlus(dt1,dt2,:185个函数调用导致错误4:在mclapply(1:nrow(ud(中,FUN=函数(x(iClusterPlus(dt1,dt2,:185个函数调用导致错误5:在mclapply(1:nrow(ud(中,FUN=函数(x(iClusterPlus(dt1,dt2,:185个函数调用导致错误

在那之后,我无法进行任何进一步的

提前感谢

对于第一个错误,我认为应该对所有dt使用"二项式"类型:type=c("二项式","二项性","二项式"(对于第二个问题-你安装了并行程序吗?也许这是个问题。

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