在R中，即使安装了Boto3，也没有Boto3连接Athena时出错

Question

我正试图从R连接到Athena。在设置"RAthena"和连接后，我得到了这个错误：

Error: Boto3 is not detected please install boto3 using either: `pip install boto3` in terminal or `install_boto()`.
Alternatively `reticulate::use_python` or `reticulate::use_condaenv` will have to be used if boto3 is in another environment.

因此，通过使用pip install，我在Python 2中和Python 3中都安装了boto3。

Requirement already up-to-date: boto3 in ./Library/Python/2.7/lib/python/site-packages (1.12.39)

Requirement already satisfied: boto3 in ./Library/Python/3.7/lib/python/site-packages (1.12.39)

但是在R中，我仍然有同样的错误。然后我尝试在R中使用install_boto()。它告诉我做如下：

Installation complete. Please restart R.

然后我将永远呆在这个Restarting R session...输出中，永远看不到任何成功重启的注释。最后，R仍然不能检测到boto3。

Answer 1

听说您的RAthena包有问题，真的很抱歉。你能告诉我你正在运行的软件包的版本吗。

你试过通过reticulate设置你正在使用的python吗？例如：

library(DBI)
# specifying python conda environment
reticulate::use_condaenv("RAthena")
# Or specifying python virtual enviroment
reticulate::use_virtualenv("RAthena")
con <- dbConnect(RAthena::athena())

你能检查一下numpy是否安装了吗？我记得如果numpy是其中的一部分，reticulate可以更好地绑定到python环境。

或者，您可以使用noctua。noctua的工作原理与RAthena完全相同，但它没有使用python的boto3，而是使用R的paws包。

如果你还在挣扎，我可以在Github上提出这个问题。我以为我已经通过将numpy添加到安装函数install_boto中解决了这个问题，但我很高兴重新打开这个问题。