如何重组Nifti文件，以便将其安装在CNN中

Question

我的大多数Nifti文件都有不同的xyZ维度。我如何安排它们，使它们具有相同的维度，然后能够在CNN中训练它们？

Answer 1

您可以对图像进行重新采样，使其具有相同的体素大小，然后裁剪它们以覆盖相同的物理大小。这一点很重要，因为如果你只是重新调整图像的大小，那么每个像素(或3D中的体素(都将是不同的物理大小，你的CNN将学习不同尺度的特征。

如果您有兴趣在Python中执行此操作，那么我强烈建议使用SimpleITK。在此基础上构建的另一个软件包是platipy，它有用于各向同性重采样和裁剪的工具，这可能很有用。