如何计算每个潜在变量的出现次数并找到它们在R中的比例?

Question

最终，我试图找到每个子组中每个潜在变量的比例。

我有一个大数据帧(Patient1)，有108.720行，包括:

• 因子变量Majority_SNP(可以是A, T, C, G或dash)
• 索引位置(1 ~ 9.060)
• 很多很多其他的东西

我最终想做一个图表，显示a, T, C, G的相对频率，破折号是"Majority_SNP"按索引位置。比如:

0.150.2500.350.25

此代码将data.frame发送到table，但table与矢量

一起工作

Patient1 %>%
table(Majority_SNP)

另一种方法是使用magrittr

中的$运算符

Patient1 %$%
table(Majority_SNP)

Orwithfrom R Base

with(Patient1 , table(Majority_SNP))

如果我们需要在dplyr函数之外的列上使用table，则pull为列

library(dplyr)
Patient1 %>%
pull(Majority_SNP) %>%
table

或与.$

Patient1 %>%
table(.$Majority_SNP)