我有125个具有相同列名的csv文件。我想把它们全部合并(on=column(。我尝试了以下代码，但它不起作用(看起来像是在无限循环中运行(。
filelist = glob.glob('*.csv')
dflist = []
for filename in filelist:
df = pd.read_csv(filename)
dflist.append(df)
df_2 = reduce(lambda left,right: pd.merge(left,right,on=['gene_id'],how='outer'), dflist)
我不能像df_new=pd.contat([df1，df2，df3，df4]，axis=1(那样使用pd.concat，因为csv文件的行长度不同。
有其他方法可以对多个文件执行pd.merge吗？？
提前感谢！！
试试这个代码。
filelist = glob.glob('*.csv')
merged_df = pd.read_csv(filelist[0])
for filename in filelist:
df = pd.read_csv(filename)
merged_df = pd.merge(merged_df, df, on = ['gene_id'], how = 'outer')