我已经用pandas, numpy, matplotlib, scikit-learn, tensorflow etc.
这样的数据科学库建立了几个环境。
但是,我无法将某些软件包更新到最新版本。
例如
conda update pandas
会告诉我我有最新版本,但我确信最新版本是1.+
(我的是0.25
(
有没有办法查看哪些程序包阻止特定程序包更新?
有一种方法可以使用插入式替换mamba
来实现。
您所要做的就是提供要更新到的包的版本,mamba
会告诉您是什么阻止了它的更新。
例如,在我的情况下,我想将snakemake
更新到>7.但mamba update snakemake
只给了我6.15。
所以我运行了:mamba install snakemake=7
,结果很有信息性:
Looking for: ['snakemake=7']
Pinned packages:
- python 3.8.*
- bcbio-gff 0.6.7.*
Encountered problems while solving:
- nothing provides yte >=1.0,<2.0 needed by snakemake-minimal-7.0.0-pyhdfd78af_0
事实证明,我忘了把-c conda-forge
包括在内,这就是yte
的来源。
正如anacondas文档中所解释的,没有真正的方法可以一步到位。您可以逐个检查每个包的依赖关系。以下链接对此进行了解释。https://conda.io/projects/conda/en/latest/user-guide/tasks/manage-pkgs.html#listing-包相关性