R:从一个向量生成所有唯一的排列

Question

我有一个向量，其中某些条目是重复的。从这个向量中，我想得到每一个可能的、唯一的排列。

环顾四周，我发现gtools::permutations()被推荐了几次，但它不能解决我的问题。

我找到了RcppAlgos::permuteGeneral()的方法，但问题是它将每个条目都视为唯一值，然后我必须在第二步中删除重复项。这可能会导致内存问题。

有没有一种简单快速的方法可以从向量中获得所有独特的排列？

这里有一个可重复的例子：

library(RcppAlgos)
ex <- c("sp1", "sp2", "sp2") # sp2 is repeated twice
perm <- permuteGeneral(v = ex, m = length(ex), repetition = FALSE, freqs = NULL)
perm <- as.data.frame(perm)
perm # some rows are identical (rows 1&2; 3&5, 4&6)
V1  V2  V3
1 sp1 sp2 sp2
2 sp1 sp2 sp2
3 sp2 sp1 sp2
4 sp2 sp2 sp1
5 sp2 sp1 sp2
6 sp2 sp2 sp1
perm[!duplicated(perm), ] # this is what I want
V1  V2  V3
1 sp1 sp2 sp2
3 sp2 sp1 sp2
4 sp2 sp2 sp1

Answer 1

这样使用它：

library(RcppAlgos)
tab <- table(ex)
permuteGeneral(v = names(tab), freq = tab)
##      [,1]  [,2]  [,3] 
## [1,] "sp1" "sp2" "sp2"
## [2,] "sp2" "sp1" "sp2"
## [3,] "sp2" "sp2" "sp1"

Answer 2

您可以尝试unique+perms

> unique(pracma::perms(ex))
[,1]  [,2]  [,3]
[1,] "sp2" "sp2" "sp1"
[2,] "sp2" "sp1" "sp2"
[3,] "sp1" "sp2" "sp2"

---

或者我们可以这样做

permuteGeneral(
v = unique(ex),
m = length(ex),
freqs = table(ex)
)

它给出

[,1]  [,2]  [,3]
[1,] "sp1" "sp2" "sp2"
[2,] "sp2" "sp1" "sp2"
[3,] "sp2" "sp2" "sp1"