作为预处理步骤，我需要从大量RNA-seq数据中选择前1000个高度可变的基因(行(，该数据包含100个不同样本(列(中的约60k个基因。列值已包含三元组的平均值。该表包含FPKM中的归一化值(注意：我无法访问原始计数，也无法使用常见的R包，因为这些包将原始计数作为输入。(在这种情况下，选择前1000个可变基因的最佳方法是什么？
我曾尝试使用rowSums((函数过滤出基因(去除行和值较低的基因(，并将其从60k基因缩小到10K基因，但我不确定这是否是选择高度可变基因的正确方法。欢迎提供任何意见。
行和是第一个过滤步骤。在此之后，您的数据将被log2foldchangecutoff和padjst值丢弃(0.05或o.o1取决于您的目标(。您可以使用不同的行和截止值重复此路径以查看结果。我个人丢弃行和零
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