我有一个巨大的输入文件，有几个列(Column10-Column28)，其中包含0/0,0/1或1/1数据条目。我想找到并替换以下内容:-
0/0 ~ 0;0/1到1;和1/1到1.
输入文件:
#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT Sample-1 Sample-2 Sample-3 Sample-4 Sample-5 Sample-7 Sample-8 Sample-9 Sample-10 Sample-11 Sample-12 Sample-13 Sample-14 Sample-15 Sample-16 Sample-17 Sample-18 Sample-19 Sample-20 Sample-21 Sample-22 Sample-23 Sample-24 Sample-25 Sample-27 Sample-28 Sample-29 Sample-30
chr10 60074 . G C . PASS ADP=10;HET=1;HOM=0;NC=0;SF=1;WT=0;AN=25;AC=0 GT:ADR:RDF:ABQ:DP:FREQ:ADF:RBQ:PVAL:SDP:AD:GQ:RDR:RD 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. .:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:..:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. .:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.
chr10 60164 . G A 39.77 PASS ADP=37;DP=20;DPB=20;EPPR=4.51363;GTI=0;HET=1;HOM=0;MQMR=27;NC=0;NS=1;NUMALT=1;ODDS=9.15713;PAIREDR=1;PQR=0;PRO=0;QR=512;RO=13;RPPR=4.51363;SF=0,1;SRF=13;SRP=31.2394;SRR=0;WT=0;AB=0.35;ABP=6.91895;AF=0.5;AO=7;DPRA=0;EPP=3.32051;LEN=1;MEANALT=1;MQM=27;PAIRED=1;PAO=0;PQA=0;QA=254;RPL=3;RPP=3.32051;RPR=4;RUN=1;SAF=7;SAP=18.2106;SAR=0;AN=56;AC=1 GT:FREQ:DP:GQ:RBQ:ADF:ADR:QR:SDP:GL:PVAL:RDR:QA:AO:RDF:AD:ABQ:RD:RO 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/1:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/1:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/1:.:20:.:.:.:.:512:.:-10.3416,0,-25.4805:.:.:254:7:.:.:.:.:13 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.
chr10 489979 489979 G A 516.73 PASS ADP=40;DP=41;DPB=41;EPPR=5.02092;GTI=0;HET=1;HOM=0;MQMR=60;NC=0;NS=1;NUMALT=1;ODDS=62.0891;PAIREDR=1;PQR=0;PRO=0;QR=999;RO=27;RPPR=3.09072;SF=0,1;SRF=17;SRP=6.95112;SRR=10;WT=0;AB=0.285714;ABP=14.1779;AF=0.5;AO=8;DPRA=0;EPP=3.0103;LEN=1;MEANALT=2;MQM=60;PAIRED=1;PAO=0;PQA=0;QA=270;RPL=3;RPP=4.09604;RPR=5;RUN=1;SAF=5;SAP=4.09604;SAR=3;AN=56;AC=4 GT:FREQ:GL:DP:ADR:RDR:GQ:AD:SDP:QR:ABQ:RDF:RO:QA:RD:ADF:RBQ:AO:PVAL 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 1/1:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/1:.:-33.3521,0,-77.8848:41:.:.:.:.:.:999:.:.:27:504:.:.:.:14:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/1:.:-57.2363,0,-62.092:44:.:.:.:.:.:832:.:.:22:778:.:.:.:21:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/1:.:-33.3521,0,-77.8848:41:.:.:.:.:.:999:.:.:27:504:.:.:.:14:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/1:.:-16.4346,0,-55.431:28:.:.:.:.:.:703:.:.:19:270:.:.:.:8:.0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.
chr10 489993 489993 G A 517.39 PASS ADP=40;DP=45;DPB=45;EPPR=3.79203;GTI=0;HET=1;HOM=0;MQMR=60;NC=0;NS=1;NUMALT=1;ODDS=93.8892;PAIREDR=1;PQR=0;PRO=0;QR=900;RO=25;RPPR=5.18177;SF=0,1;SRF=15;SRP=5.18177;SRR=10;WT=0;AB=0.275862;ABP=15.6647;AF=0.5;AO=8;DPRA=0;EPP=3.0103;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;PAIRED=1;PAO=0;PQA=0;QA=270;RPL=5;RPP=4.09604;RPR=3;RUN=1;SAF=5;SAP=4.09604;SAR=3;AN=56;AC=4 GT:RDF:ABQ:QR:ADF:RBQ:AO:PVAL:RD:QA:RO:ADR:DP:FREQ:GL:GQ:AD:SDP:RDR 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/1:.:.:900:.:.:20:.:.:687:25:.:45:.:-48.5936,0,-67.7665:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/1:.:.:834:.:.:22:.:.:784:22:.:45:.:-57.4791,0,-61.9781:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/1:.:.:900:.:.:20:.:.:687:25:.:45:.:-48.5936,0,-67.7665:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/1:.:.:777:.:.:8:.:.:270:21:.:29:.:-15.8938,0,-58.4546:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.
chr10 490056 . T C 612.45 PASS ADP=59;DP=69;DPB=69;EPPR=6.8707;GTI=0;HET=1;HOM=0;MQMR=59.75;NC=0;NS=1;NUMALT=1;ODDS=141.021;PAIREDR=1;PQR=0;PRO=0;QR=1092;RO=36;RPPR=3.25157;SF=0,1;SRF=19;SRP=3.25157;SRR=17;WT=0;AB=0.486486;ABP=3.06899;AF=0.5;AO=18;DPRA=0;EPP=33.8935;LEN=1;MEANALT=1;MQM=57.5;PAIRED=1;PAO=0;PQA=0;QA=634;RPL=18;RPP=7.35324;RPR=5;RUN=1;SAF=11;SAP=4.9405;SAR=7;AN=56;AC=3 GT:SDP:FREQ:RBQ:RDR:RDF:GL:RO:ADR:ADF:QR:AD:RD:ABQ:PVAL:AO:QA:GQ:DP 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/1:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/1:.:.:.:.:.:-69.4469,0,-78.8411:36:.:.:1092:.:.:.:.:29:997:.:69 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/1:.:.:.:.:.:-60.0267,0,-33.0544:15:.:.:491:.:.:.:.:23:799:.:38 0/0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0/1:.:.:.:.:.:-10,0,-10:19:.:.:580:.:.:.:.:18:634:.:37
输出文件:
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chr10 60074 . G C . PASS ADP=10;HET=1;HOM=0;NC=0;SF=1;WT=0;AN=25;AC=0 GT:ADR:RDF:ABQ:DP:FREQ:ADF:RBQ:PVAL:SDP:AD:GQ:RDR:RD 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. .:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:..:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. .:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.
chr10 60164 . G A 39.77 PASS ADP=37;DP=20;DPB=20;EPPR=4.51363;GTI=0;HET=1;HOM=0;MQMR=27;NC=0;NS=1;NUMALT=1;ODDS=9.15713;PAIREDR=1;PQR=0;PRO=0;QR=512;RO=13;RPPR=4.51363;SF=0,1;SRF=13;SRP=31.2394;SRR=0;WT=0;AB=0.35;ABP=6.91895;AF=0.5;AO=7;DPRA=0;EPP=3.32051;LEN=1;MEANALT=1;MQM=27;PAIRED=1;PAO=0;PQA=0;QA=254;RPL=3;RPP=3.32051;RPR=4;RUN=1;SAF=7;SAP=18.2106;SAR=0;AN=56;AC=1 GT:FREQ:DP:GQ:RBQ:ADF:ADR:QR:SDP:GL:PVAL:RDR:QA:AO:RDF:AD:ABQ:RD:RO 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 1:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 1:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 1:.:20:.:.:.:.:512:.:-10.3416,0,-25.4805:.:.:254:7:.:.:.:.:13 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.
chr10 489979 489979 G A 516.73 PASS ADP=40;DP=41;DPB=41;EPPR=5.02092;GTI=0;HET=1;HOM=0;MQMR=60;NC=0;NS=1;NUMALT=1;ODDS=62.0891;PAIREDR=1;PQR=0;PRO=0;QR=999;RO=27;RPPR=3.09072;SF=0,1;SRF=17;SRP=6.95112;SRR=10;WT=0;AB=0.285714;ABP=14.1779;AF=0.5;AO=8;DPRA=0;EPP=3.0103;LEN=1;MEANALT=2;MQM=60;PAIRED=1;PAO=0;PQA=0;QA=270;RPL=3;RPP=4.09604;RPR=5;RUN=1;SAF=5;SAP=4.09604;SAR=3;AN=56;AC=4 GT:FREQ:GL:DP:ADR:RDR:GQ:AD:SDP:QR:ABQ:RDF:RO:QA:RD:ADF:RBQ:AO:PVAL 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 1:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 1:.:-33.3521,0,-77.8848:41:.:.:.:.:.:999:.:.:27:504:.:.:.:14:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 1:.:-57.2363,0,-62.092:44:.:.:.:.:.:832:.:.:22:778:.:.:.:21:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 1:.:-33.3521,0,-77.8848:41:.:.:.:.:.:999:.:.:27:504:.:.:.:14:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 1:.:-16.4346,0,-55.431:28:.:.:.:.:.:703:.:.:19:270:.:.:.:8:.0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.
chr10 489993 489993 G A 517.39 PASS ADP=40;DP=45;DPB=45;EPPR=3.79203;GTI=0;HET=1;HOM=0;MQMR=60;NC=0;NS=1;NUMALT=1;ODDS=93.8892;PAIREDR=1;PQR=0;PRO=0;QR=900;RO=25;RPPR=5.18177;SF=0,1;SRF=15;SRP=5.18177;SRR=10;WT=0;AB=0.275862;ABP=15.6647;AF=0.5;AO=8;DPRA=0;EPP=3.0103;LEN=1;MEANALT=1;MQM=60;PAIRED=1;PAO=0;PQA=0;QA=270;RPL=5;RPP=4.09604;RPR=3;RUN=1;SAF=5;SAP=4.09604;SAR=3;AN=56;AC=4 GT:RDF:ABQ:QR:ADF:RBQ:AO:PVAL:RD:QA:RO:ADR:DP:FREQ:GL:GQ:AD:SDP:RDR 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 1:.:.:900:.:.:20:.:.:687:25:.:45:.:-48.5936,0,-67.7665:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 1:.:.:834:.:.:22:.:.:784:22:.:45:.:-57.4791,0,-61.9781:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 1:.:.:900:.:.:20:.:.:687:25:.:45:.:-48.5936,0,-67.7665:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 1:.:.:777:.:.:8:.:.:270:21:.:29:.:-15.8938,0,-58.4546:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.
chr10 490056 . T C 612.45 PASS ADP=59;DP=69;DPB=69;EPPR=6.8707;GTI=0;HET=1;HOM=0;MQMR=59.75;NC=0;NS=1;NUMALT=1;ODDS=141.021;PAIREDR=1;PQR=0;PRO=0;QR=1092;RO=36;RPPR=3.25157;SF=0,1;SRF=19;SRP=3.25157;SRR=17;WT=0;AB=0.486486;ABP=3.06899;AF=0.5;AO=18;DPRA=0;EPP=33.8935;LEN=1;MEANALT=1;MQM=57.5;PAIRED=1;PAO=0;PQA=0;QA=634;RPL=18;RPP=7.35324;RPR=5;RUN=1;SAF=11;SAP=4.9405;SAR=7;AN=56;AC=3 GT:SDP:FREQ:RBQ:RDR:RDF:GL:RO:ADR:ADF:QR:AD:RD:ABQ:PVAL:AO:QA:GQ:DP 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 1:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 1:.:.:.:.:.:-69.4469,0,-78.8411:36:.:.:1092:.:.:.:.:29:997:.:69 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 1:.:.:.:.:.:-60.0267,0,-33.0544:15:.:.:491:.:.:.:.:23:799:.:38 0:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:.:. 1:.:.:.:.:.:-10,0,-10:19:.:.:580:.:.:.:.:18:634:.:37
谁能建议一个简单的方法，也许awk + gsub命令??
0/0 to 0;0/1到1;和1/1到1.
观察:在每种情况下，您都希望用/之后的内容替换expression。我会利用GNUsed这个任务之后,为了简便起见,我将使用file.txt如下
text 0/0 text
text 0/1 text
text 1/1 text
text text text
text 0/0 text 0/1 text 1/1 text
然后
sed 's|[01]/([01])|1|g' file.txt
给输出
text 0 text
text 1 text
text 1 text
text text text
text 0 text 1 text 1 text
解释:我选择使用|而不是/以避免转义后者，因为您有字面上的/。我使用捕获组替换(s)0或1，然后是/，然后是0或1，使用最后一部分(0或1在/之后)，并在全局范围内(g)将这种更改应用于每行中的所有出现。
(在GNU sed 4.2.2中测试)
你试过用
sed 's/0/0/0/g' file | sed 's/0/1/1/g' | sed 's/1/1/1/g'
应该这样做:
{m,g}awk ++NF OFS= FS='[01]/'