在SLURM作业脚本中设置并传递字符串变量



我有一个SLURM作业脚本,如下所示:

#!/bin/bash

#SBATCH -o ./out/%x.%j.%N.out
#SBATCH -e ./out/%x.%j.%N.err
#SBATCH -D ./
#SBATCH -J matlab_serial_batch_job
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --tasks-per-node=1
#SBATCH --cpus-per-task=1
#SBATCH --time=0:30:00

module load slurm_setup
module load matlab/R2021a-generic

NROWA=1000
NCOLA=2000
NROWB=2000
NCOLB=5000
MYSTRING='blablabla'

# Run MATLAB
matlab -nodisplay -singleCompThread 
-r "matmul_serial([$NROWA $NCOLA], [$NROWB $NCOLB], $MYSTRING);"

我想设置一个名为MYSTRING的字符串变量并将其传递给MATLAB函数matmul_serial。然而,我得到了以下错误:

Unrecognized function or variable 'blablabla'

对于那些整数变量NROWANROWBNCOLANCOLB,它们工作得很好。如何在此上下文中正确设置和传递字符串变量MYSTRING

实际上,在赋值过程中,单引号将被Bash分条。

❯ MYSTRING='blablabla'
❯ echo $MYSTRING
blablabla

你可以试着逃离这样的报价:

❯ MYSTRING='blablabla'
❯ echo $MYSTRING
'blablabla'

否则,Matlab错误地认为blablabla是变量或函数的名称,而不是字符串文字。但是,由于在blablabla周围添加了一个引号,因此错误消息具有误导性。但是这些单引号并不是您在MYSTRING=...赋值中插入的引号,如下面的交互式Matlab会话中所示。

$ matlab
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         March 8, 2019

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>> blablabla
Undefined function or variable 'blablabla'.

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