我是nifti世界的初学者，必须将两个nifti(一个分割的白质图像和一个分割后的灰质图像(叠加在一起。我试过FSLeyes，但我没能把他们救出来。
如果有人处理过同样的问题，并且能提供帮助，那就太好了，感谢
FSLeyes有很好的文档，您可以从命令行读取如何加载所有图像。如果你的两个分段被称为seg1.nii.gz和seg2.nii.gz，根据上面的URL，你可以用显示它们
fsleyes -sortho -std1mm seg1.nii.gz -cm red-yellow seg2.nii.gz -cm blue-lightblue
这将在高分辨率标准空间解剖背景上以不同的颜色显示它们。
查看图像不会将它们保存为新文件。如果两个分割都是二进制的，那么你可以将它们放在一个卷中，使用：
fslmaths seg1 -sub seg2 seg12
则seg12.nii.gz将在灰色背景上显示seg1的部分为正(FSLeyes中为白色(而seg2的部分为负(FSLeyes中为黑色(。
如果你需要这方面的建议，可以更容易地在FSL邮件列表中询问，在那里你可以询问更多FSL特定的问题。
如果我理解正确，一种方法是使用nifti查看器，如FSLeyes，加载两个图像，然后调整每个图像的透明度，直到可以同时看到两个图像。我想你需要从这里拍一张截图，或者其他一些技巧性的东西。
覆盖两个nifti文件的另一种方法是使用nifti转换工具，如AFNI中的3dcalc，将两个图像合并在一起。您需要将两个图像加载到工具中，然后指定如何合并图像，例如将值相加或相乘。