从scipy.cluster.hhierarchy.dendrogram中获取高度

Question

我需要从树状图中获取节点的高度我的计划是使用dcord/icord，但从物理上考虑所得图的高度和相应2d数组中的值。

根据这篇文章，dcord和icoord反映了树中节点的坐标。在scipy.cluster.hhierarchy.dendrogram文档中，icoord/dord的含义非常不明显。所以我无法回溯上发生的事情

感谢的任何见解

import numpy as np
import pandas as pd
from scipy.cluster import hierarchy
import matplotlib.pyplot as plt
data = [[24, 16], [13, 4], [24, 11], [34, 18], [41, 
6], [35, 13]]
frame = pd.DataFrame(np.array(data),
columns=["a", "b"],
index=["Atlanta", "Boston", "Chicago", "Dallas", "Denver", "Detroit"])
Z = hierarchy.linkage(frame, 'single')
plt.figure()
dn = hierarchy.dendrogram(Z, labels=frame.index)

高度大概是[15，10，9，5]，但我想让python把这个数组给我，而不是我盯着它看。

Answer 1

您可以从dn['dcoord']中列表的第二个或第三个元素中提取该信息。

在这里，我已经运行了您的脚本。y坐标取自dn['dcoord']:中每个列表的索引1

In [190]: [y[1] for y in dn['dcoord']]
Out[190]: 
[5.0,
5.0990195135927845,
9.219544457292887,
10.198039027185569,
13.038404810405298]

正如我在评论中所指出的，你可以看到这些数据被用来增强这个答案中的树状图。