如何从python向R-脚本传递整数参数

Question

我有下面发布的R代码，我想从python代码中传递参数n并显示结果。也就是说，如果我通过了4，那么16必须打印在屏幕上。请让我知道如何将arguments从python 传递到R-脚本

R-代码：

Square <- function(n) {
return(n^2)
}

Python代码:

command ='Rscript'
path2Func1Script ='/var/www/aw/Rcodes/func-1.R'
args = [3]
cmd = [command, path2Func1Script]
output = None
try:
x = subprocess.call(cmd + args, shell=True)
print("x: ", x)
except subprocess.CalledProcessError as e:
output = e.output
print("output: ", output)

Answer 1

解决方案：

我看到你是手动完成这项工作的。我建议你使用一个很棒的python库，名为rpy2。Rpy2提供了许多功能，可以使用python本身的R库和函数，而无需使用子进程在python的命令行参数中手动调用r脚本，这不仅使代码更容易编写，而且更高效。

需要注意的最重要的一点是，要将python整数列表解析为r函数，您需要将其转换为rIntVector，就像robjects.vectors.IntVector()一样。另一件事是，如果您使用的是windows ，则需要将R_HOME环境变量设置为r安装的路径

首先使用conda安装rpy2(pip仅适用于带有此软件包的linux(：

conda install -c conda-forge rpy2

以下是代码python代码：

import rpy2.robjects as robjects

# Defining the R script and loading the instance in Python
r = robjects.r
r['source']('func-1.R')
# Loading the function we have defined in R.
square_func = robjects.globalenv['Square']
# defining the args
args = robjects.vectors.IntVector([3])
#Invoking the R function and getting the result
result_r = square_func(args)
#printing it.
print('x: ' , result_r)

输出：

x: [1] 9