r-CRAN包装依赖于生物导管包装



包gRbase、gRain和gRim(我维护(都使用Bioconductor上包RBGL、graph和Rgraphviz的功能。这意味着用户不能直接安装我的软件包(必须执行的setRepository->BioC软件(。这当然不是世界上最大的问题,但它是一个巨大的问题,会给人们带来麻烦,或者让一些人放弃使用我的软件包。

我的问题是:是否有任何规定,例如在描述中,RBGL、graph和Rgraphviz必须从Bioconductor安装,这样我的软件包的用户就不会遇到这种麻烦?如果有办法解决这个问题,那就太好了。

致以最良好的问候瑟伦

您可以在DESCRIPTION文件中添加一行biocViews:。在这种情况下,它还将检查Bioconductor的包依赖性,并从那里安装它们。

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