UnResolvedPackage: Anaconda conda Environment O2MConverter



我一直在尝试通过创建conda环境并安装项目O2MConverter (https://github.com/aikkala/O2MConverter.git)中指定的依赖项和pip包来安装这个github存储库。yml文件。

但是,我在conda中打包了多个未解决的问题,这些问题无法在conda中提供的任何通道中找到。

> conda env create --name O2MConverter --file=conda_env.yml
> conda activate O2MConverter
> python O2MConverter.py opensim_model_file.osim /location/where/converted/model/will/be/saved /location/where/geometry/files/are

有人能解决conda_env中提供的依赖问题吗?yml文件?这里是详尽的列表,所有未解决的包都可以在下面看到。我特意丢弃了构建号,以便在任何构建中解决它,这将导致软件包冲突。

包含所需版本的包名,无法解析但构建号将被丢弃。

- krb5=1.14.6
- xz=5.2.4
- hdf4=4.2.13
- tk=8.5.19
- xorg-libxdmcp=1.1.3
- freeglut=3.0.0
- xorg-libxi=1.7.10
- openblas=0.3.9
- jsoncpp=1.8.4
- expat=2.2.9
- libssh2=1.8.0
- libgfortran-ng=7.3.0
- libxcb=1.13
- libiconv=1.15
- vtk=8.2.0
- xorg-fixesproto=5.0
- xorg-libx11=1.6.9
- openssl=1.0.2u
- xorg-xextproto=7.3.0
- patchelf=0.10
- lz4-c=1.8.3
- freetype=2.10.1
- _openmp_mutex=4.5
- pthread-stubs=0.4
- scipy=1.4.1
- tbb=2020.1
- zlib=1.2.11
- xorg-kbproto=1.0.7
- icu=64.2
- libpng=1.6.37
- readline=6.2
- xorg-libice=1.0.10
- sqlite=3.13.0
- libwebp-base=1.1.0
- libxml2=2.9.10
- libstdcxx-ng=9.2.0
- pandas=1.0.3
- xorg-libxext=1.3.4
- llvm-openmp=9.0.1
- xorg-libxau=1.0.9
- xorg-libsm=1.2.3
- xorg-inputproto=2.3.2
- xorg-libxt=1.2.0
- curl=7.61.0
- libnetcdf=4.6.2
- _libgcc_mutex=0.1
- zstd=1.4.4
- libopenblas=0.3.9
- ncurses=5.9
- libuuid=2.32.1
- hdf5=1.10.4
- libtiff=4.1.0
- xorg-libxfixes=5.0.3
- scikit-learn=0.22.2.post1
- bzip2=1.0.8
- jpeg=9c
- libgcc-ng=9.2.0
- xorg-xproto=7.0.31

原始conda_env。yml文件:

name: O2MConverter
channels:
- conda-forge
- https://conda.anaconda.org/conda-forge/
- defaults
dependencies:
- _libgcc_mutex=0.1=conda_forge
- _openmp_mutex=4.5=1_llvm
- bzip2=1.0.8=h516909a_2
- ca-certificates=2020.4.5.1=hecc5488_0
- certifi=2020.4.5.1=py36h9f0ad1d_0
- curl=7.61.0=h93b3f91_2
- expat=2.2.9=he1b5a44_2
- freeglut=3.0.0=hf484d3e_1005
- freetype=2.10.1=he06d7ca_0
- future=0.18.2=py36h9f0ad1d_1
- hdf4=4.2.13=hf30be14_1003
- hdf5=1.10.4=nompi_h3c11f04_1106
- icu=64.2=he1b5a44_1
- joblib=0.14.1=py_0
- jpeg=9c=h14c3975_1001
- jsoncpp=1.8.4=hc9558a2_1002
- krb5=1.14.6=0
- libblas=3.8.0=16_openblas
- libcblas=3.8.0=16_openblas
- libgcc-ng=9.2.0=h24d8f2e_2
- libgfortran-ng=7.3.0=hdf63c60_5
- libiconv=1.15=h516909a_1006
- liblapack=3.8.0=16_openblas
- libnetcdf=4.6.2=hbdf4f91_1001
- libopenblas=0.3.9=h5ec1e0e_0
- libpng=1.6.37=hed695b0_1
- libssh2=1.8.0=h1ad7b7a_1003
- libstdcxx-ng=9.2.0=hdf63c60_2
- libtiff=4.1.0=hc7e4089_6
- libuuid=2.32.1=h14c3975_1000
- libwebp-base=1.1.0=h516909a_3
- libxcb=1.13=h14c3975_1002
- libxml2=2.9.10=hee79883_0
- llvm-openmp=9.0.1=hc9558a2_2
- lz4-c=1.8.3=he1b5a44_1001
- natsort=7.0.1=py_0
- ncurses=5.9=10
- openblas=0.3.9=he1df0ab_0
- openssl=1.0.2u=h516909a_0
- pandas=1.0.3=py36h830a2c2_0
- patchelf=0.10=he1b5a44_0
- pip=20.0.2=py_2
- pthread-stubs=0.4=h14c3975_1001
- python=3.6.1=3
- python-dateutil=2.8.1=py_0
- python_abi=3.6=1_cp36m
- pytz=2019.3=py_0
- readline=6.2=0
- scikit-learn=0.22.2.post1=py36hcdab131_0
- scipy=1.4.1=py36h2d22cac_2
- setuptools=46.1.3=py36h9f0ad1d_0
- six=1.14.0=py_1
- sk-video=1.1.10=pyh24bf2e0_4
- sqlite=3.13.0=1
- tbb=2020.1=hc9558a2_0
- tk=8.5.19=2
- vtk=8.2.0=py36ha8e561a_202
- wheel=0.34.2=py_1
- xmltodict=0.12.0=py_0
- xorg-fixesproto=5.0=h14c3975_1002
- xorg-inputproto=2.3.2=h14c3975_1002
- xorg-kbproto=1.0.7=h14c3975_1002
- xorg-libice=1.0.10=h516909a_0
- xorg-libsm=1.2.3=h84519dc_1000
- xorg-libx11=1.6.9=h516909a_0
- xorg-libxau=1.0.9=h14c3975_0
- xorg-libxdmcp=1.1.3=h516909a_0
- xorg-libxext=1.3.4=h516909a_0
- xorg-libxfixes=5.0.3=h516909a_1004
- xorg-libxi=1.7.10=h516909a_0
- xorg-libxt=1.2.0=h516909a_0
- xorg-xextproto=7.3.0=h14c3975_1002
- xorg-xproto=7.0.31=h14c3975_1007
- xz=5.2.4=h516909a_1002
- zlib=1.2.11=h516909a_1006
- zstd=1.4.4=h3b9ef0a_2
- pip:
- admesh==0.98.9
- cffi==1.14.0
- cloudpickle==1.3.0
- cycler==0.10.0
- cython==0.29.16
- fasteners==0.15
- glfw==1.11.0
- imageio==2.8.0
- kiwisolver==1.1.0
- matplotlib==3.2.1
- monotonic==1.5
- pillow==7.0.0
- pycparser==2.20
- pyglet==1.5.0
- pynput==1.6.8
- pyparsing==2.4.6
- pyquaternion==0.9.5
- python-xlib==0.27
- redis==3.4.1
- timeout-decorator==0.4.1
prefix: /home/aleksi/anaconda3/envs/O2MConverter

有谁能帮我用anaconda或虚拟环境构建环境吗?

我尝试使用conda构建环境,并尝试使用相同的包使项目pip可安装。在pip可安装的情况下,pip安装admesh不起作用。使用conda构建时,我遇到了无法解决的包,然后删除了所有的构建版本,这导致了包冲突,conda无法解决它们。

是linux特有的。人们必须手动删减其他平台不可用的包,才能使某些东西跨平台工作。否则,在Docker或类似的程序中运行。例如,mambaforgeimage:

可以正常工作
$ docker run --rm -it condaforge/mambaforge:latest
(base) root@ef04142624c1:/# mamba env create -n foo -f https://github.com/aikkala/O2MConverter/raw/master/conda_env.yml

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