为什么我不能在空对象上调用方法view()

Question

为什么我不能在null对象上调用方法view()…我的代码是:

workflow parsefq {
take: samplesheet
main:
Channel.fromPath( samplesheet )
.splitCsv ( header:true, sep:'t' ) // dict: [sample:test1, fqdir:xxx, barcode: 10, 11]
.map { create_fastq_channel(it) }   //[test1, [fq1, fq2]]
.set {reads}
emit: reads
}
def create_fastq_channel(LinkedHashMap row) {...return [row.sample, fq1s, fq2s]}
workflow {
ch_input = file(params.input)
parsefq (ch_input)
.set {ch_fq}
.view()      //got error on this
}

Answer 1

您会得到上面的错误，因为set操作符只返回null。它仅用于将变量名分配给通道。通常我们在通道操作链的末尾使用set操作符。如果我们不需要对输出应用任何转换，我们可以使用=赋值操作符分配通道名称:

workflow {
ch_input = file(params.input)
ch_fq = parsefq(ch_input)
ch_fq.view()
}