R控制每行数据帧的连续NA值的数量

Question

有一些措辞相似的问题，但不完全是我想做的。

我有一个数据帧，我想在其中删除具有n个连续NA值的行。

1   Manhattan   NA      2300    NA      2275    2300    
2   Manhattan   2999    2975    NA      NA      2995    
3   Manhattan   NA      NA      NA      NA      4400    
4   Manhattan   6725    6500    6750    6995    6800    
5   Brooklyn    2000    1995    1975    2000    1999    
6   Bronx       1200    3200    NA      NA      NA

我有一些工作代码可以删除n个总NA值，但我想连续调整它。

delete.na <- function(df, n=0) {
df[rowSums(is.na(df)) <= n,]
}
df <- delete.na(df,3)

因此，在这种情况下，在删除具有3个连续NA值的行之后，我会有：

1   Manhattan   NA      2300    NA      2275    2300    
2   Manhattan   2999    2975    NA      NA      2995    
4   Manhattan   6725    6500    6750    6995    6800    
5   Brooklyn    2000    1995    1975    2000    1999    

Answer 1

一个选项是在行上循环，用rle检查以返回相同的相邻元素的值和长度列表(这里是逻辑向量(is.na-即TRUE-表示NA，FALSE表示非NA(，因为"值"是逻辑的，用它来子集"长度"，检查all是否小于3，并用它作为行索引来子集行

df[apply(df, 1, function(x) all(with(rle(is.na(x)), lengths[values]) <3)),]
#     city col1 col2 col3 col4 col5
#1 Manhattan   NA 2300   NA 2275 2300
#2 Manhattan 2999 2975   NA   NA 2995
#4 Manhattan 6725 6500 6750 6995 6800
#5  Brooklyn 2000 1995 1975 2000 1999

数据

df <- structure(list(city = c("Manhattan", "Manhattan", "Manhattan", 
"Manhattan", "Brooklyn", "Bronx"), col1 = c(NA, 2999L, NA, 6725L, 
2000L, 1200L), col2 = c(2300L, 2975L, NA, 6500L, 1995L, 3200L
), col3 = c(NA, NA, NA, 6750L, 1975L, NA), col4 = c(2275L, NA, 
NA, 6995L, 2000L, NA), col5 = c(2300L, 2995L, 4400L, 6800L, 1999L, 
NA)), class = "data.frame", row.names = c("1", "2", "3", "4", 
"5", "6"))