我正在尝试使用lme4和glht对线性混合模型进行Dunnett测试。我设置并运行的模型如下
Untransformed.lmer <- lmer(Sum ~ Treatment + (1|Block), data = EggCounts_poolSUM)
anova(Untransformed.lmer)
summary(glht(Untransformed.lmer, linfct = mcp(Treatment = 'Dunnett'), alternative = 'less'))
当我运行时,我得到以下输出
Simultaneous Tests for General Linear Hypotheses
Multiple Comparisons of Means: Dunnett Contrasts
Fit: lmer(formula = Sum ~ Treatment + (1 | Block), data = EggCounts_poolSUM)
Linear Hypotheses:
Estimate Std. Error z value Pr(<z)
75 - 0 >= 0 -914.2 911.6 -1.003 0.372
150 - 0 >= 0 -1207.4 911.6 -1.325 0.243
300 - 0 >= 0 -2162.2 911.6 -2.372 0.030 *
600 - 0 >= 0 -1446.3 911.6 -1.587 0.160
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
(Adjusted p values reported -- single-step method)
有人能解释为什么所有的治疗都会出现相同的标准误差吗?我做错什么了吗?
治疗i
的Dunnett标准误差为sqrt(s2) * sqrt(1/ni + 1/n0)
,其中s2
是合并方差估计,ni
是治疗i
的观察次数,n0
是参考组的观察次数。因此,在ni
相等的情况下,标准误差都是相同的。您的数据可能就是这样。