如何在字符串的第一个undershore之前提取所有内容



我有这样命名的文件:

MG-AB-110_S101_R2_001.fastq.gz, MG-AB-109_S100_R1_001.fastq.gz...

我正在尝试提取第一个下划线之前的所有内容,以便获得:MG-AB-110,MG-AB-109…

我试着这样做:

name="MG-AB-110_S101_R2_001.fastq.gz"
base_name=${name%%.*}
echo $base_name
MG-AB-110_S101_R2_001

这个:

base_name=${name%%(.*?)_.* }
echo $base_name
MG-AB-110_S101_R2_001.fastq.gz

我需要这些基本名称来匹配另一个文件夹中的基本名称,所以上面的regex将是这个循环的一部分:

#!/bin/bash
for name in test1/*.gz; do
base_name=${name%%.*}
if [ -f "test2/$base_name" ]; then
cat "$name" "test2/$base_name" >"all_combined/$base_name"
else
printf 'No file in test2 corresponds to "%s"n' "$name" >&2
fi
done

使用bash及其参数扩展:

name="MG-AB-110_S101_R2_001.fastq.gz"
echo "${name%%_*}"

输出:

MG-AB-110

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