标记字符串中每个Python值为0或1的字符

Question

我有一个包含核苷酸值的字符串。我想用0和1标记这串上的所有核苷酸。在这里，A/G/C/T值可以在任何位置。

例如

str = 'AGCTAGG' 

，我想在这个字符串上保留一个额外的值，我可以稍后更改。

初始值为0:

new-str = {A:0,G:0,C:0,T:0,A:0,G:0,G:0}

之后我想给我想要的核苷酸赋1

new-str = {A:1,G:0,C:1,T:0,A:0,G:1,G:0}

字母将按照字符串中的顺序排列。

我在这里可以使用的最佳方法是什么?

默认字典也没有给我想要的。

dict
defaultdict
hashmap

Answer 1

将标记放在与字符串长度相同的单独列表中。如果你想把标记和字符串放在一起，你可以把它们做成一个对象，或者用更少的模板，一个命名元组(namedtuple)，但本质上你希望它们是两个独立的东西。

如果你想遍历带有标记的基因，使用zip:

for gn, mk in zip(genes, marks):
# do something with gn amd mk

就我个人而言，我会使用True和False而不是0或1。但这是一个小细节。