Docker中没有名为conda的模块

我正在尝试创建一个带有miniconda3的docker映像。我不想直接使用docker hub中提供的基本映像，而是想从头开始，创建自己的Dockerfile，并将continuumio/miniconda3映像的Dockerfle命令放在那里，它们是：

FROM debian:latest
#  $ docker build . -t continuumio/miniconda3:latest -t continuumio/miniconda3:4.5.11
#  $ docker run --rm -it continuumio/miniconda3:latest /bin/bash
#  $ docker push continuumio/miniconda3:latest
#  $ docker push continuumio/miniconda3:4.5.11
ENV LANG=C.UTF-8 LC_ALL=C.UTF-8
ENV PATH /opt/conda/bin:$PATH
RUN apt-get update --fix-missing && 
apt-get install -y wget bzip2 ca-certificates curl git && 
apt-get clean && 
rm -rf /var/lib/apt/lists/*
RUN wget --quiet https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-4.5.11-Linux-x86_64.sh -O ~/miniconda.sh && 
/bin/bash ~/miniconda.sh -b -p /opt/conda && 
rm ~/miniconda.sh && 
/opt/conda/bin/conda clean -tipsy && 
ln -s /opt/conda/etc/profile.d/conda.sh /etc/profile.d/conda.sh && 
echo ". /opt/conda/etc/profile.d/conda.sh" >> ~/.bashrc && 
echo "conda activate base" >> ~/.bashrc
ENV TINI_VERSION v0.16.1
ADD https://github.com/krallin/tini/releases/download/${TINI_VERSION}/tini /usr/bin/tini
RUN chmod +x /usr/bin/tini
ENTRYPOINT [ "/usr/bin/tini", "--" ]
CMD [ "/bin/bash" ]

构建和运行容器工作正常。作为参考，这里是容器中conda info的输出：

(base) root@def48bd1ed5d:/# conda info
active environment : base
active env location : /opt/conda
shell level : 1
user config file : /root/.condarc
populated config files : 
conda version : 4.5.11
conda-build version : not installed
python version : 3.7.0.final.0
base environment : /opt/conda  (writable)
channel URLs : https://repo.anaconda.com/pkgs/main/linux-64
https://repo.anaconda.com/pkgs/main/noarch
https://repo.anaconda.com/pkgs/free/linux-64
https://repo.anaconda.com/pkgs/free/noarch
https://repo.anaconda.com/pkgs/r/linux-64
https://repo.anaconda.com/pkgs/r/noarch
https://repo.anaconda.com/pkgs/pro/linux-64
https://repo.anaconda.com/pkgs/pro/noarch
package cache : /opt/conda/pkgs
/root/.conda/pkgs
envs directories : /opt/conda/envs
/root/.conda/envs
platform : linux-64
user-agent : conda/4.5.11 requests/2.19.1 CPython/3.7.0 Linux/4.4.0-187-generic debian/10 glibc/2.28
UID:GID : 0:0
netrc file : None
offline mode : False

每当我尝试使用conda安装模块时，就会出现这个问题，例如conda install jupyter -y。这个过程开始了，在安装过程中的某个时刻，我得到了这个错误：

Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
Traceback (most recent call last):
File "/opt/conda/bin/conda", line 7, in <module>
from conda.cli import main
ModuleNotFoundError: No module named 'conda'
(base) root@def48bd1ed5d:/#

在这之后，安装似乎被破坏了。如果我再次尝试使用conda命令调用exmapleconda info，我会得到相同的错误：

(base) root@def48bd1ed5d:/# conda info
Traceback (most recent call last):
File "/opt/conda/bin/conda", line 7, in <module>
from conda.cli import main
ModuleNotFoundError: No module named 'conda'
(base) root@def48bd1ed5d:/#

Dockerfile中安装行中指定的miniconda3

版本不是最新版本您用来构建本地映像的Dockerfile将安装miniconda3-4.5.11，而不是最新版本。你可以在这里找到：

...
RUN wget --quiet https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-4.5.11-Linux-x86_64.sh -O ~/miniconda.sh && 
/bin/bash ~/miniconda.sh -b -p /opt/conda &&
...

同样以这种方式与docker:

$ docker build --tag miniconda3:test .
$ docker docker run -i -t miniconda3:test /bin/bash
$ docker history --no-trunc miniconda3:test | grep Miniconda3
/bin/sh -c wget --quiet https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-4.5.11-Linux-x86_64.sh -O ~/miniconda.sh && ...

好的，现在让我们看看官方continuumio/miniconda3:

$ docker run -i -t continuumio/miniconda3 /bin/bash

然后：

$ docker history --no-trunc continuumio/miniconda3 | grep Miniconda3
/bin/sh -c wget --quiet https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -O ~/miniconda.sh && ...

正如您所看到的，DockerHub的continuumio/miniconda3镜像安装了最新的miniconda34.8.2，而不是4.5.11版本。因此，从该Dockerfile构建的本地映像将生成具有miniconda3:4.5.11的容器。

`python`版本的更改打破了`conda`

现在，让我们来弄清楚conda失败的原因。首次构建并运行：

$ docker build --tag miniconda3:test .
$ docker docker run -i -t miniconda3:test /bin/bash

获取一些信息：

(base) root@61cafd17d954:/# conda info
active environment : base
active env location : /opt/conda
shell level : 1
user config file : /root/.condarc
populated config files : 
conda version : 4.5.11
conda-build version : not installed
python version : 3.7.0.final.0
base environment : /opt/conda  (writable)
channel URLs : https://repo.anaconda.com/pkgs/main/linux-64
https://repo.anaconda.com/pkgs/main/noarch
https://repo.anaconda.com/pkgs/free/linux-64
https://repo.anaconda.com/pkgs/free/noarch
https://repo.anaconda.com/pkgs/r/linux-64
https://repo.anaconda.com/pkgs/r/noarch
https://repo.anaconda.com/pkgs/pro/linux-64
https://repo.anaconda.com/pkgs/pro/noarch
package cache : /opt/conda/pkgs
/root/.conda/pkgs
envs directories : /opt/conda/envs
/root/.conda/envs
platform : linux-64
user-agent : conda/4.5.11 requests/2.19.1 CPython/3.7.0 Linux/5.4.0-48-generic debian/10 glibc/2.28
UID:GID : 0:0
netrc file : None
offline mode : False

我们有conda:4.5.11和python:3.7.0。

现在，我们将安装jupyter，例如：

(base) root@61cafd17d954:/# conda install jupyter

您可能会注意到，此安装将更新python:

The following packages will be UPDATED:
...
python:             3.7.0-hc3d631a_0        --> 3.8.5-h7579374_1       
...

如果继续，这将更新python并破坏conda:

...
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
Traceback (most recent call last):
File "/opt/conda/bin/conda", line 7, in <module>
from conda.cli import main
ModuleNotFoundError: No module named 'conda'

这是一个众所周知的问题，您可以在"如何使用conda安装包来更改我的python版本并删除conda？"中找到有关此问题的更多信息？答案，在官方的conda repo中：没有名为conda.cli的模块。

更新`conda`或将`Dockerfile`用于`miniconda3:latest`

这个问题有三种可能的解决方案：

通过替换此行来编辑Dockerfile：

RUN wget --quiet https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-4.5.11-Linux-x86_64.sh -O ~/miniconda.sh &&

带有

RUN wget --quiet https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -O ~/miniconda.sh &&

使用ContinuumIO的最新官方Dockerfile，您可以在此处找到它。
使用前更新容器内的conda：

(base) root@61cafd17d954:/# conda update conda

`python`版本的更改打破了`conda`

更新`conda`或将`Dockerfile`用于`miniconda3:latest`

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