我有一个ped和一个包含90个种群的映射文件,我希望使用PLINK分别对每个种群执行MAF过滤。最终输出可以是每个族的单独输出,或者在最佳情况下,是每个族中保留(或排除(变体的数据集。
我是否应该首先将map和ped文件拆分为90个其他map和ped文件(每个族一个(,然后对每个种群执行PLINK命令?或者PLINK有没有办法同时完成这两个步骤?
提前感谢!
已解决:使用命令--freq--family,创建了所需的表。现在我只需要根据列";MAF";。