我正在对VCF文件进行分析，在使用vcfR::maf函数后，我得到了一个包含四列的数据框架:a, B, C, D，每个列都有数字作为值，没有NA。
我将数据帧输出到csv文件中，这就是它的样子
我将此数据帧命名为AF，现在正尝试根据值根据列D筛选行，只留下列D>= 0.1中的数字，并将新数据帧命名为AF_MAF
我使用了这个代码
AF2_MAF <- AF2 %>% filter (Frequency>=0.1)
在遇到不同的错误后，我寻找解决方案并执行
library(magrittr)
library(dplyr)
现在我得到一个新的错误:
UseMethod("filter")错误:没有适用于类"c"("矩阵"、"数组"、"双精度"、"数字")对象的"筛选器"方法
我搜索了，没有找到相应的解决方案。请帮忙，非常感谢!
使用subsetfrombase R
subset(AF2, AF2[, "Frequency"] >= 0.1)
从错误消息看来，AF2是一个矩阵，您可以将其更改为数据框架，然后您的代码应该工作。
AF2_MAF <- AF2 %>% as.data.frame() %>% filter (Frequency>=0.1)
或者，您也可以将矩阵子集。
AF2_MAF <- AF2[AF2[, "Frequency"] >= 0.1, ]