熊猫数据帧中的共生矩阵



问题

我有一个pandas数据帧,我需要计算数据帧中每个唯一条目出现在每个其他条目的同一行中的行数。


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可再现设置

import pandas as pd
import numpy as np

数据帧:

df = pd.DataFrame({'a': ['A', 'A', 'B', 'B'],
'b': ['B', 'C', 'B', 'B'],
'c': ['C', 'A', 'C', 'A'],
'd': ['B', 'D', 'B', 'A']},
index=[0, 1, 2, 3])

即:

+----+-----+-----+-----+-----+
|    | a   | b   | c   | d   |
|----+-----+-----+-----+-----|
|  0 | A   | B   | C   | B   |
|  1 | A   | C   | A   | D   |
|  2 | B   | B   | C   | B   |
|  3 | B   | B   | A   | A   |
+----+-----+-----+-----+-----+

(使用此打印。(


我尝试了什么

我试着使用答案中的代码,&替换这些变量:

document = [list(each) for each in df.values]
names = list(np.unique(df.values))

它给出了错误的结果:

A B C D
A 4 6 3 2
B 6 10 5 0
C 3 5 0 1
D 2 0 1 0

它是基于迭代的,所以我希望有更好的解决方案。


预期输出

+----+-----+-----+-----+-----+
|    |   A |   B |   C |   D |
|----+-----+-----+-----+-----|
| A  | nan |   2 |   2 |   1 |
| B  |   2 | nan |   2 |   0 |
| C  |   2 |   2 | nan |   1 |
| D  |   1 |   0 |   1 | nan |
+----+-----+-----+-----+-----+

存在CCD_ 1行,其中CCD_;B同时出现,因此单元格行AB中的值为2。存在CCD_ 7行,其中CCD_;C同时出现,因此单元格行20列C中的值为2


问题

如何在Pandas中轻松获得此逐行共现矩阵如果我不必遍历这些值,那就太好了。


(pandas.Categorical可能有一些用处,我还没能让它工作。(

我们可以先执行stack,然后执行get_dummiesdot,然后值

s=df.stack().str.get_dummies().sum(level=0).ne(0).astype(int)
s=s.T.dot(s).astype(float)
np.fill_diagonal(s.values, np.nan)
s
Out[33]: 
A    B    C    D
A  NaN  2.0  2.0  1.0
B  2.0  NaN  2.0  0.0
C  2.0  2.0  NaN  1.0
D  1.0  0.0  1.0  NaN

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