根据R列中的部分匹配创建新变量



我正试图在data.frame中创建一个基于以下数据的新变量:

df <- structure(list(id = c(123L, 123L, 332L, 332L, 332L, 100L, 100L, 
113L, 113L, 113L, 113L, 551L, 551L), icpc = c("D95", "F85", "A01", 
"A04", "K20", "B10", "A04", "T08", "P28", "D95", "A04", "B12", 
"D95"), icpc2 = c("F15", "", "", "", "", "", "", "", "", "A01", 
"", "A01", ""), reg.date = c("19JUN2015", "15AUG2016", "16MAR2010", 
"20JAN2018", "20FEB2017", "01JUN2017", "11JAN2008", "18MAR2018", 
"19JAN2017", "16JAN2013", "01MAY2009", "03APR2011", "09MAY2015"
)), class = "data.frame", row.names = c(NA, -13L))

我已经为新列condit:使用了以下代码

library(data.table)
cond1 <- c("D95", "A01")
setDT(df)[, condit := ifelse(any(icpc %in% cond1 | icpc2 %in% cond1), "yes","no"), by=id]
df

然而,我正在处理一个大型数据集(>4000万(,并且还想根据icpcicpc2中的字母进行分类。

我的目标是在列icpcicpc2中有一个字母A(即A01A04A50等(的情况下添加一个新列,该列给出yesno。我还希望具有相同id的所有列在新列condit2中具有yes

我正在尝试以下内容:

df2 <- setDT(df)[, condit2 := ifelse
(any(icpc %in% pmatch("K", df) | icpc2 %in% pmatch("K", df)), "yes","no"), by = PATNR]
head(df2)

它一直在运行。。。(我想,无论如何,df都太面包了,如果应该是df$icpcdf$icpc2?(

然后检查pmatch是否合适:

condit2 <- pmatch("K")

然后看了一个完全不同的东西:

library(sqldf)
condit2 <- sqldf("df$icpc | df$icpc2, '%K%'")

这将导致以下数据帧:

id  icpc icpc2 reg.date    condit2
1: 123  D95   F15 19JUN2015    no
2: 123  F85       15AUG2016    no
3: 332  A01       16MAR2010    yes
4: 332  A04       20JAN2018    yes
5: 332  K20       20FEB2017    yes
6: 100  B10       01JUN2017    yes
7: 100  A04       11JAN2008    yes
8: 113  T08       18MAR2018    yes
9: 113  P28       19JAN2017    yes
10: 113  D95   A01 16JAN2013    yes
11: 113  A04       01MAY2009    yes
12: 551  B12   A01 03APR2011    yes
13: 551  D95       09MAY2015    yes

有人能给个提示吗?谢谢

setDT(df)
to_check <- 'A'
df[, condit2 := fifelse(any(grepl(to_check, icpc) | grepl(to_check, icpc2)),
'yes', 'no'), 
by = id]
df
#      id icpc icpc2  reg.date condit2
#  1: 123  D95   F15 19JUN2015      no
#  2: 123  F85       15AUG2016      no
#  3: 332  A01       16MAR2010     yes
#  4: 332  A04       20JAN2018     yes
#  5: 332  K20       20FEB2017     yes
#  6: 100  B10       01JUN2017     yes
#  7: 100  A04       11JAN2008     yes
#  8: 113  T08       18MAR2018     yes
#  9: 113  P28       19JAN2017     yes
# 10: 113  D95   A01 16JAN2013     yes
# 11: 113  A04       01MAY2009     yes
# 12: 551  B12   A01 03APR2011     yes
# 13: 551  D95       09MAY2015     yes

如果不是只有两列icpcicpc2,而是有一堆它们,并且不想为每一列都键入grepl代码,那么这里的.SDcols版本会给出相同的结果。

df[, condit2 := fifelse(any(Reduce('|', lapply(.SD, grepl, patt = to_check))),
'yes', 'no'), 
by = id, .SDcols = patterns('icpc')]

对于dplyr,可以使用以下方法完成:group_by(id)paste将感兴趣的两列放在一起,并使用sumgrepl检查连接字符串中是否出现至少一个A

library(dplyr)
df %>% 
group_by(id) %>% 
mutate(condit2 = case_when(sum(grep("A", paste(icpc, icpc2))) > 0 ~ "yes",
TRUE ~ "no")) %>% 
ungroup()

id icpc  icpc2 reg.date  condit2
<int> <chr> <chr> <chr>     <chr>  
1   123 D95   "F15" 19JUN2015 no     
2   123 F85   ""    15AUG2016 no     
3   332 A01   ""    16MAR2010 yes    
4   332 A04   ""    20JAN2018 yes    
5   332 K20   ""    20FEB2017 yes    
6   100 B10   ""    01JUN2017 yes    
7   100 A04   ""    11JAN2008 yes    
8   113 T08   ""    18MAR2018 yes    
9   113 P28   ""    19JAN2017 yes    
10   113 D95   "A01" 16JAN2013 yes    
11   113 A04   ""    01MAY2009 yes    
12   551 B12   "A01" 03APR2011 yes    
13   551 D95   ""    09MAY2015 yes    

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