r语言 - 具有重复测量的线性混合效应模型的先验和事后功率分析



我们进行了一项初步研究,我们有一个线性混合效应模型来重复测量结果:

lmer(value ~ time * group * condition + (1 | id), 
data = data)

value:带有数字变量的响应时间(只有这个是数字的,其他的用于分组)时间:干预前后(t1 - t2)组:三个不同的干预组条件:奖励和中性条件

有一些显著的结果(p值),如:

t value Pr(>|t|)    
(Intercept)                       8.042 3.89e-10 ***
timeT3                            2.886  0.00517 ** 
groupEF                           0.691  0.49332    
groupUMC                          0.633  0.53014    
conditionreward                   1.360  0.17819    
timeT3:groupEF                   -1.670  0.09942 .  
timeT3:groupUMC                  -1.723  0.08931 .  
timeT3:conditionreward           -2.362  0.02093 *  
groupEF:conditionreward          -0.898  0.37226    
groupUMC:conditionreward         -1.183  0.24060    
timeT3:groupEF:conditionreward    1.195  0.23601    
timeT3:groupUMC:conditionreward   1.860  0.06700 .  

我必须做两件事:

  1. 我必须进行事后功率分析以计算该试验的效应大小)
  2. 我必须根据试点结果进行先验功率分析,以计算主要研究参数。第一步我失败了。

我的第一个问题是是否有一个好的R包。我找到了& effectsize&;并进行了相同的https://cran.r-project.org/web/packages/effectsize/vignettes/from_testrongtatistics.html#in-linear-mixed-models

然而,据我所知,它首先将模型转换为ANOVE。我的第二个问题是当我得到方差分析结果时,我失去了显著的结果,这是正常的吗?:

Type III Analysis of Variance Table with Satterthwaite's method
Sum Sq Mean Sq NumDF  DenDF F value  Pr(>F)
time                 4147.4  4147.4     1 70.476  2.8898 0.09355
group                   7.7     3.8     2 23.406  0.0027 0.99733
condition             698.1   698.1     1 70.476  0.4864 0.48782
time:group           1961.5   980.8     2 70.479  0.6834 0.50823
time:condition       4529.9  4529.9     1 70.476  3.1563 0.07995
group:condition       124.3    62.2     2 70.479  0.0433 0.95763
time:group:condition 5043.6  2521.8     2 70.479  1.7571 0.18002

然后它通过F_to_eta2()函数改变f分数,这在以前的结果中没有给出(但我假设它将t值更改为eta2)。

与下面的示例链接不同,它给了我很多行,可能是因为模型太复杂了。那么,我是否应该像这样分别计算每一行的eta: F_to_eta2(2.88, 2,23.406)?难道没有机会计算全部吗?

将线性混合模型改为方差分析,然后计算效应大小是否有意义?最后,我如何基于效应大小(eta 2)运行先验的功率分析来检测样本量?

我认为我不能回答你关于方差分析的问题,但是,如果你正在寻找一个程序来估计基于试点研究的lmer所需的参与者数量,simr包正好提供了这个。我建议你看看他们的论文,里面有所有必要的细节。

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