如果i from list=dict打印值，请将列表与dict中的键进行比较

Question

给定一个以三元组为键、氨基酸为值的dict(generate_translation_dict(，我想将三元组列表与该字典中现有的键进行比较。如果它们相等，则应该打印值。

例如：

generate_translation_dict = {'ATA': 'I',
'ATC': 'I',
'ATT': 'I',
'ATG': 'M',
}
comparison_list = [ 
'ATG',
'TTT',
'GTT',
]

如果列表中的某个项(例如"ATG"(与dict中的键相同，则应打印"M"。比较列表是从文本文件导入的，包含约1200个项目。

到目前为止我的代码：

triplets = [] #This block imports the tripplets
with open('triplets.txt', 'r') as infile:
for line in infile:
line = line.strip('n') # um n zu entfernen
triplets.append(line)
aa = [] # aa for amino acids
with open('amino_acids.txt', 'r') as infile:
for line in infile:
line = line.strip('n') # um n zu entfernen
aa.append(line)
generate_translation_dict = {} # empty dictionary
for n in range(len(triplets)): 
generate_translation_dict[triplets[n]] = aa[n] # adding elements to the dict # triplets added as keys/ aa added as value
print(generate_translation_dict)
tripletsequence = []
with open('triplet_sequence.txt', 'r') as infile:
for line in infile:
line = line.strip('n') # um n zu entfernen
tripletsequence.append(line)

正如您所看到的，三元组序列就是列表。比较应该是一个循环，直到列表完成。

Answer 1

一旦您有了翻译dict，您所需要做的就是在triplet_sequence中迭代，并将三元组用作dict中的键。

您还可以通过zipping两个文件流并将结果放入dict理解中来极大地简化翻译dict的创建：

with open('triplets.txt') as triplets, open('amino_acids.txt') as aa:
translation = {
t.strip(): a.strip() 
for t, a in zip(triplets, aa)
}
with open('triplet_sequence.txt') as f:
triplet_sequence = [
translation[t.strip()]
for t in f
]
print("n".join(triplet_sequence))

% cat triplets.txt
ATA
ATC
ATT
ATG
% cat amino_acids.txt
I
I
I
M
% cat triplet_sequence.txt
ATG
ATT
ATC
% python test.py
M
I
I

Answer 2

一旦你有了翻译词典(请检查最后的建议(：

translation_dict = {
'ATA': 'I',
'ATC': 'I',
'ATT': 'I',
'ATG': 'M',
'TTT': 'P',
'GTT': 'V'
}

密码子列表：

comparison_list = [ 
'ATG',
'TTT',
'GTT',
]

你可以通过这种方式解码到氨基酸序列：

seq = [translation_dict[k] for k in comparison_list]
print(seq) #=> ['M', 'P', 'V']

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如果你觉得这是个好主意，使用get((方法可以避免丢失密钥的错误(在丢失密钥的情况下返回None作为元素(：

seq = [translation_dict.get(k) for k in comparison_list]

或者，删除None元素：

seq = list(filter(None, [translation_dict.get(k) for k in comparison_list]))

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我建议将翻译dict存储为JSON文件，以便直接加载为dict，随时可用。