C++ Array to HDF5

Question

我需要在.h5文件中存储来自两个float32数组的数据。这两个数组的大小都是76800 (240x320)，每个数组都表示一个图像。我很乐意将这两个数组存储在.h5文件中，但由于我是c++的初学者，我不知道如何做到这一点。

我看了这里，但转换到一个多数组似乎不是我的情况下所必需的。尽管这看起来是一个非常简单的问题，但我找不到一个简单的代码示例。

下面是我的代码:

H5::H5File file("/home/m/Desktop/tryout/file.h5", H5F_ACC_TRUNC);
// Vector X
hsize_t dims_pol[1] = {f->flow_x.size()};
H5::DataSpace dataspace_x(1, dims_pol);
H5::IntType datatype_x(H5::PredType::NATIVE_FLOAT);
H5::DataSet dataset_x(file.createDataSet("p", datatype_x, dataspace_x));
dataset_x.write(f->flow_x.data(), H5::PredType::NATIVE_UINT8);
dataset_x.close();

然而，这只将一个向量写入文件，另外，我不能在python中打开文件(使用pandas)。它可以与h5dump一起使用。

谢谢你的帮助

Answer 1

解决问题的一种方法是在c++中使用HDFql，如下所示:

// declare variables 'arr1' and 'arr2'
float arr1[240][320];
float arr2[240][320];
// populate variable 'arr1' with values
// populate variable 'arr2' with values
// register variable 'arr1' for subsequent usage (by HDFql)
HDFql::variableTransientRegister(&arr1);
// create dataset 'dset1' of data type float (size 240x320) populated with values from 'arr1'
HDFql::execute("create dataset dset1 as float(240, 320) values from memory 0");
// register variable 'arr2' for subsequent usage (by HDFql)
HDFql::variableTransientRegister(&arr2);
// create dataset 'dset2' of data type float (size 240x320) populated with values from 'arr2'
HDFql::execute("create dataset dset2 as float(240, 320) values from memory 0");

更多信息可以在HDFql参考手册中找到。

Answer 2

我想我找到了解决方案，虽然我不是很高兴，因为熊猫(python)不能打开它，我不得不使用h5py。

然而，这是我的代码。如果你看到任何改进，请告诉我。

#include "H5Cpp.h"
H5::H5File file("/home/m/Desktop/tryout/file.h5", H5F_ACC_TRUNC);
// Vector X
hsize_t dims_pol[1] = {f->flow_x.size()};
H5::DataSpace dataspace_x(1, dims_pol);
H5::IntType datatype_x(H5::PredType::NATIVE_FLOAT);
H5::DataSet dataset_x(file.createDataSet("x", datatype_x, dataspace_x));
dataset_x.write(f->flow_x.data(), H5::PredType::NATIVE_FLOAT);
dataset_x.close();
// Vector Y
H5::DataSpace dataspace_y(1, dims_pol);
H5::IntType datatype_y(H5::PredType::NATIVE_FLOAT);
H5::DataSet dataset_y(file.createDataSet("y", datatype_y, dataspace_y));
dataset_y.write(f->flow_y.data(), H5::PredType::NATIVE_FLOAT);
dataset_y.close();