r语言 - 如何从嵌套在多层次列表中的数据中提取信息?



我试图从mapply嵌套在lapply中产生的复杂列表中提取数据。目的是生成具有不同输入组合的模型模拟。如果有帮助,请参阅其他这篇文章:如何使用mapply来处理不相等长度的输入集,使用参数组合?

输出是如下所示的列表:

> output
[[1]]
[,1]      [,2]      [,3]           
Variable1     Numeric,2 Numeric,5 Numeric,7
Variable2     Integer,2 Integer,5 Integer,7
[[2]]
[,1]      [,2]      [,3]           
Variable1     Numeric,2 Numeric,5 Numeric,7
Variable2     Integer,2 Integer,5 Integer,7
...

此结构在列表中重复n次,与lapply请求的次数相同。我想提取最后一个每个元素([[1]],[[2]],[[3]]等)的每列([,1],[,2],[,3])的Variable1

理想情况下,输出应该是长格式的数据帧,其中包含列表级别和变量名称以及提取的值:

List_index    Column    Last_value_Variable1
[[1]]         [,1]      5
[[1]]         [,2]      2
[[1]]         [,3]      7
[[2]]         [,1]      8
[[2]]         [,2]      1
[[2]]         [,3]      9
...           ...     ...

如果需要,可以重命名列表索引和变量名。我不确定我在处理什么类型的对象(一个列表,但嵌套的列表里面…),还有一点不同……)。我知道如何手动访问较低层的最后一个元素(下面的代码),但不知道如何迭代该过程。

> output[[1]][,1]$Variable1[-1]
5
> output[[2]][,3]$Variable1[-1]
9

output上使用dput返回类似这样的东西(简化了,因为实际的太长了):

structure(list(
c(1, 2), c(80L, 80L), c(2.2, 20.3),
c(1, 2, 3, 4, 5), c(62L, 62L, 62L, 62L, 62L), c(1.7, 15.9, 24.4, 30.5, 35.2),
c(1, 2, 3, 4, 5, 6, 7), c(25L, 25L, 25L, 25L, 25L, 25L, 25L), c(1.7, 15.9, 24.4, 30.5, 35.2, 39.1, 42.4)),
#[rest of the list removed for clarity because it's too long]
.Dim = c(16L, 11L),
.Dimnames = list(c("Variable1", "Variable2", "Variable3", "Variable4", "Variable5", "Variable6", "Variable7", "Variable8", "Variable9", "Variable10", "Variable11", "Variable12", "Variable13", "Variable14", "Variable15", "Variable16"),
NULL))

模型是一个函数,它返回一个数据帧,其中包含16个变量和与模型输入之一对应的可变数量的观测值。该模型使用一组11个参数输入进行测试(因此上面的dput()中的.Dim = c(16L, 11L))。

我需要运行不同输入组合的模拟。列表的第一级([[i]])对应于一个参数输入范围(馈入lapply函数),第二级([,j])对应于另一组参数馈入mapply函数(在本例中为11)。

一般来说(因为没有提供数据),这应该工作得很好:

sapply(output, function(x) x[,1]$Variable1[-1])

列表可能很复杂(你的列表看起来就是这样),在我看来,你在提取一个值时所做的是正确的第一步。然后你只需要考虑如何编写一个函数来访问这个元素,并把它放在另一个*apply循环中,让它在列表的每个元素上工作。

顺便说一句,我现在可能会使用purrr::map_int(),因为它确保您从每次迭代中获得的是单个整数值。

@JCGruber的建议帮助我找到了解决方案。我在sapply周围包装了一个for循环,以对列表的每个子元素(在我的示例中为11)重复提取过程。

l <- list()
for (i in 1:11)){
l[i] <- as.data.frame(sapply(output, function(x) tail(x[,i]$Variable1, 1)), 4)
}
> l
[[1]]
[1]  0.8794 23.7201 46.5609
[[2]]
[1]  5.4517 25.7046 45.9574
[[3]]
[1]  8.6468 26.0620 43.4773
[[4]]
[1] 25.3687 40.9850 56.6014
[[5]]
[1] 28.9796 41.0070 53.0343
[[6]]
[1]  0.913 23.699 46.485
[[7]]
[1] 34.3093 45.8173 57.3253
[[8]]
[1] 30.9206 42.1212 53.3218
[[9]]
[1]  0.9130 22.4922 44.0714
[[10]]
[1] 44.4389 57.3425 70.2460
[[11]]
[1] 57.3268 67.5774 77.8280

我们可以找到列表的11个元素,每个子列表的最后3个值,从我感兴趣的变量(variable1)中获得。抱歉,如果确切的值在这个例子中不对应。最终,每个列表元素的位置是最重要的。现在整理数据要容易得多。再次感谢你@JCGruber让我走上了正确的道路。

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