GNU并行使用在M1Mac运行OSX 13.1

Question

我在MacStudio中安装了一个gnu并行的brew;

(base) ~ % brew info parallel
==> parallel: stable 20221222 (bottled), HEAD
Shell command parallelization utility
https://savannah.gnu.org/projects/parallel/
(base) ~ % parallel --version
GNU parallel 20221222
Copyright (C) 2007-2022 Ole Tange, http://ole.tange.dk and Free Software
Foundation, Inc.

我用sed玩pipe-part，如下;

parallel -a -eta -vv SRR8758324_2.fastq -k --block 30M --pipe-part 'sed "s/+.*/+/"' > SRR8758324_2.mod.fastq

当我通过htop监控cpu使用情况时，我可以看到所有的20个内核都亮起了。

然而，当我解雇了下面的人;

parallel -j 20 --eta  -vv 'sed "s/+.*/+/"'  :::  SRR8758324_2.fastq > SRR8758324_2.mod.fastq 

只使用了一个核心。我真的很感激你告诉我我错过了什么。

'c.          
,xNMM.          
.OMMMMo           OS: macOS 13.1 22C65 arm64
OMMM0,            Host: Mac13,2
.;loddo:' loolloddol;.      Kernel: 22.2.0
cKMMMMMMMMMMNWMMMMMMMMMM0:    Uptime: 9 hours, 19 mins
.KMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWd.    Packages: 181 (brew)
XMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMX.      Shell: zsh 5.9
;MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM:       Resolution: 3440x1440
:MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM:       DE: Aqua
.MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMX.      WM: Quartz Compositor
kMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMWd.    WM Theme: Blue (Light)
.XMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMk   Terminal: iTerm2
.XMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMK.   Terminal Font: Monaco 10
kMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMd     CPU: Apple M1 Ultra
;KMMMMMMMWXXWMMMMMMMk.      GPU: Apple M1 Ultra
.cooc,.    .,coo:.        Memory: 3099MiB / 131072MiB 

Answer 1

在第二个示例中，您只是在一个文件上运行sed的一个实例。

在第一个中，由于--pipe-part，您要求GNU Parallel将文件分割成多个块，并在一个新作业中处理每个块。