我对RNA-seq领域真的很陌生，正试图将我的数据与STAR的病毒基因组进行比对。然而，我经常收到下面提到的错误。我试图更改节点数量(10(、线程数量(48(，并有大约200G的内存来运行我的作业，但这似乎没有帮助。。。有什么建议吗？
代码：12月24日19:09:40。。。。。启动STAR运行
12月24日19:09:40。。。。。加载基因组
12月24日19:09:41。。。。。已启动映射分段故障(堆芯转储(’
谢谢！
您是如何创建STAR索引的？我这么问是因为它取决于基因组的大小(我想你的基因组很小，因为它是病毒(，也许你使用的是默认值，而不是最佳值。
根据手册说明：
对于小基因组，参数
--genomeSAindexNbases必须按比例缩小最小值(14，log2(基因组长度(/2-1(。例如，对于1兆碱基的基因组，这是相等的到9，对于100千碱基基因组，这等于7。
STAR --runThreadN 16
--runMode genomeGenerate
--genomeDir </path/to/your/starIndex/directory>
--genomeFastaFiles </your/reference/file>
--genomeSAindexNbases <your_numerical_value>