根据重新启动尝试调整时间限制

Question

我有一个工作流，它需要一个令人尴尬的并行步骤，对于一个slurm集群来说，该步骤具有不同的资源需求(内存和时间(。我根据文档装饰了工作流程：

rule freebayes:
...
resources:
mem = lambda wildcards, attempt: attempt * 6144,
time = lambda wildcards, attempt: attempt * 12 * 60
...

这是成功提交的，并且正确地请求了内存需求，但time需求在配置文件中设置为默认值。在日志中，它似乎还可以：

resources: mem=6144, time=720

我还尝试以字符串形式请求时间：

time = lambda wildcards, attempt: str(attempt * 12) + ":00:00"

它也提交了ok，但仍设置为默认时间。

我做错了什么？

Answer 1

我刚刚注意到我做错了什么。由于以下行，我的cluster.json覆盖了请求：

"__default__":
{
"time": "24:00",
},

我去掉了它，现在它工作得很好。