用破折号分隔的单词的grep

Question

我有一堆像这样的字符串，我想从一个包含许多其他字符串的文件中提取：

chr2:95183661-95183776
chr9:951d2483661-95182423776

我正在寻找一种方法来grep这个特定的模式，但中间的破折号会导致问题。以下是我尝试过的：

grep  -w --color -o -E  "chr[0-9]:[0-9]-[0-9]*" 

Answer 1

我创建了一个测试文件，以便检查正则表达式：

Prompt> cat test.txt
chr2:95183661-95183776
chr9:951d2483661-95182423776blabla
blabla

我想出了以下正则表达式：

"chr[0-9]*:[0-9a-z]*-[0-9]*"

具有以下含义：

• [0-9]*：任意位数
• :：冒号，前面有一个反斜杠，以便将其视为真实字符，而不是通配符
• [0-9a-z]*：任意数量的小写字母或数字
• -：一个连字符，前面有一个反斜杠，以便将其视为真实字符，而不是通配符(如[0-9](

测试：

Prompt> grep -o "chr[0-9]*:[0-9a-z]*-[0-9]*" test.txt
chr2:95183661-95183776
chr9:951d2483661-95182423776