我正在尝试用Conda(Windows PC(安装Trimmomatic,但我看到的错误是:CondaVerificationError:trimmomatic的包位于C:\Users\Utente\anaconda3\pkgs\trimmomatic-0.39-hdfd78af_2似乎已损坏。路径"共享/trimmomatic"找不到包清单中指定的。
ClobberError:由于"library/bin/freetype.dll"的路径冲突。此路径已存在于目标前缀中,不会删除通过此事务中的卸载操作。路径是conda无法识别。它可能是由另一个包管理器创建的。
其他.dll文件重复出现Clobber错误。
我已经尝试过";干净——全部";以及";update-all";但它不起作用。我也尝试卸载和安装Conda和Python,但没有任何改变。我认为问题是存在多个文件夹,因为我安装Conda的次数更多,但删除每个文件夹对我没有帮助。如果你能帮我的话,我提前感谢你。
我不知道是什么,但trimmomatic包中的符号链接似乎有问题,在windows下不起作用。
尝试用openjdk:创建一个环境
conda create -c conda-forge --override-channels -n trimmomatic openjdk
然后手动下载二进制文件,提取它,然后运行
conda activate trimmomatic
java -jar Trimmomatic-0.39trimmomatic-0.39.jar
因此,调整Trimmomatic-0.39trimmomatic-0.39.jar
以指向从下载的.zip文件中提取的文件夹内的.jar
文件