我有一个函数,我在其中执行一些操作,并希望使用numba来加速它。在我的代码中,使用高级索引更改数组中的值是不起作用的。我想他们在麻木的文件中确实这么说了。但是像numpy.put((这样的解决方法是什么?
这里有一个我想做的简单例子:
#example array
array([[ 0, 1, 2],
[ 0, 2, -1],
[ 0, 3, -1]])
使用在numba中工作的任何方法更改给定索引处的值。。。获得:在[0,0]、[1,2]、[2,1]时更改的值
#changed example array by given indexes with one given value (10)
array([[ 10, 1, 2],
[ 0, 2, 10],
[ 0, 10, -1]])
以下是我在python中所做的,但不使用numba:
indexList是一个Tuple,它与numpy.take((一起工作
这是python代码的工作示例,数组中的值更改为100。
x = np.zeros((151,151))
print(x.ndim)
indexList=np.array([[0,1,3],[0,1,2]])
indexList=tuple(indexList)
def change(xx,filter_list):
xx[filter_list] = 100
return xx
Z = change(x,indexList)
现在在函数上使用@jit:
@jit
def change(xx,filter_list):
xx[filter_list] = 100
return xx
Z = change(x,indexList)
编译正在返回到对象模式,并启用了环举,因为函数";改变";类型推理失败,原因是:找不到签名的函数function((的实现:setitem(数组(float64,2d,C(,UniTuple(阵列(int32,1d,C(x 2(,Literalint(
出现此错误。所以我需要一个变通办法。numba不支持numpy.put((。
我会很乐意提出任何想法。
谢谢
如果将indexList
保留为数组不是问题,则可以将其与change
函数中的for
循环结合使用,使其与numba:兼容
indexList = np.array([[0,1,3],[0,1,2]]).T
@njit()
def change(xx, filter_list):
for y, x in filter_list:
xx[y, x] = 100
return xx
change(x, indexList)
注意,为了使y
、x
坐标沿着第一轴,必须对indexList
进行换位。换句话说,它必须具有(n, 2)
而不是(2, n)
的形状才能改变n
点。实际上,它现在是一个坐标列表:[[0, 0],[1, 1],[3, 2]]
@mandulaj发布了前进的道路。在mandulaj给出答案之前,我走了一条有点不同的路。
使用此功能,我会收到一个弃用警告。。。所以最好的方法是使用@mandulaj,不要忘记转换indexList。
@jit
def change_arr(arr,idx,val): # change values in array by np index array to value
for i,item in enumerate(idx):
arr[item[0],item[1]]= val
return arr