我正在尝试使用《应用生物信息学概论》中的Jupyter笔记本。我的电脑是带有Ventura操作系统的Mac M1,我使用Python 3.9.2。当我使用来自iab的包到达单元时,我得到错误消息。例如
iab的。show_F
error no module named iab.
我找不到一个iab包来加载它,即使我安装了scikit bio.
所有使用iab模块的代码单元失败。
如果您打算继续使用第一版的内容,请参阅此处。
我建议你试着在笔记本电脑的新单元格中运行如下操作:
%pip install https://github.com/caporaso-lab/An-Introduction-To-Applied-Bioinformatics/archive/master.zip
然后重新启动内核,现在from iab.algorithms import show_F
应该工作了。