从UMAP连通性计算邻接矩阵?

Question

从knn-graph中，我们可以使用scipy包计算邻接矩阵，方法如下:

ids = df.index
knn = kneighbors_graph(df.values, n_neighbors, metric = metric, 
mode = 'connectivity').toarray()
knn = pd.DataFrame(knn, columns = ids, index = ids)

这给了我们一个邻接矩阵对于KNN-neighbor?

同样，我们如何从UMAP和t-SNE算法中得到连通性邻接矩阵?

Answer 1

在umap_learn和cuml(vers)。>22.06)，UMAP.fit()返回一个.graph_，这是邻接输出