Biopython SeqIO 错误：分配前引用'qual'局部变量

Question

我将一些用于Sanger测序的样本发送到商业设施。我可以使用命令读取他们发送的文件

from Bio import SeqIO
from Bio import Seq
rec = SeqIO.read("isolation-round4/3dr23_Forward.ab1",'abi-trim').seq

但最近，由于一项举措，我们不得不将样本送往其他地方进行测序。现在，如果我试图在输出上运行相同的命令，我会得到一个错误：

UnboundLocalError: local variable 'qual' referenced before assignmentFile "C:UsersAnaconda3libsite-packagesBioSeqIOAbiIO.py", line 462, in AbiIterator letter_annotations={"phred_quality": qual}

如果能帮我处理这件事，我将不胜感激。如果你想看看的话，这里有两个文件，一个有效，一个无效。

提前感谢您的帮助！

Answer 1

错误应该已经在Biopython 1.77 中修复

更新：请参阅https://github.com/biopython/biopython/issues/3221-原来是ABI软件的一种新的意外配置，生成的文件没有质量分数。