规则特定的散射聚集指令

Question

在Snakemake关于定义散点聚集规则的文档中，scattergather指令是全局设置的。是否可以为每个规则设置特定值？例如，rule a拆分为8，rule b拆分为4？

Answer 1

可以为特定的分散收集过程定义自定义名称，例如：

scattergather:
split_a=8,
split_b=4,

如果要使用scatter.split，请使用scatter.split_a或scatter.split_b，并类似地替换gather.split。这里提供了完整的示例Snakefile。

编辑：请注意，截至7.12.0，snakemake中当前存在一个错误，无法正确处理此情况。这个PR中有一个修复程序，但它可能需要一些时间才能集成到主版本中

编辑：要使用此功能，请确保您的snakemake已更新到7.12.1或更高版本。